El Museo Convento San Francisco y Catacumbas de Lima implementa áreas y talleres de conservación, organiza eventos académicos y realiza actividades que buscan el empoderamiento de sus visitantes con el bien monumental y patrimonial. El museo busca, así, consolidarse como uno de los principales museos de arte religioso que abre sus puertas en el Centro Histórico de Lima, gracias no solo al reconocimiento de sus catacumbas, sino también por su destacado patrimonio,como su importante colección de azulejos, su pinacoteca, sus artesonados, sus tallas
y altares.